Instynkt u konia jest bardzo silny.

Koń jest zwierzęciem płochliwym, w przypadku zagrożenia ratuje się za każdym razem ucieczką. Gdy koń się wystraszy potrafi bardzo szybko i gwałtownie przyspieszyć co często jest bardzo niebezpieczne dla jeźdźca.

W warunkach naturalnych konie żyły na olbrzymich przestrzeniach pól i lasów. W poszukiwaniu pożywienia przemierzały dziesiątki kilometrów. Z tego powodu w chwili obecnej jeśli koń jest długo zamknięty w swoim boksie i nie może się wybiegać jest bardzo nieszczęśliwy i że to wpływa na jego psychikę.

Jednym z widocznych instynktów konia jest mowa uszu oraz rżenie. Jeśli koń kładzie uszy do tyłu oznacza to, że jest zdenerwowany i zły. Jeśli natomiast ma uszy nastawione do przodu - jest życzliwy i zainteresowany.
Rżenie w mowie koni oznacza wyrażanie uczuć i emocji. W zależności od rodzaju rżenia koń może wzywać inne konie, pozdrawiać osobę karmiąca go itp.